小丸子是一名小学二年级的女生,她活泼、好动、懒惰、什么事情都拖到最后一刻才做、学习不认真、成绩平平、经常和姐姐斗气、爱幻想、做事没恒心……在小丸子身上我们或多或少都看到了自己童年的影子。如果小丸子算是一个“怪人”的话,那么她的周围可谓“怪人”多多,有点神经质的班长丸尾同学、权利欲极强的女副班长、经常和小丸子一起疯的爷爷,讨人厌的宾治同学等等,这群性格各异、精力充沛的小孩、大人们,每天都在演绎着生活的趣事,伴随着小丸子一天天长大。
在都市内出现了连续女性被杀事件。经警察调察,犯案者是异形怪物,而主角·风祭真因为一直发着相关事件的梦而备受困扰…… 风祭真的父亲是遗传学研究所里的科学家。而真则自愿成为了研制不治之病的实验品,但却被疯狂的科学家·鬼塚实行的现阶段最危险的生化实验·Lv3的遗传因子操作实验而变成了生化战士:真·假面骑士。但鬼塚最大的目的就是要将真供幕后BOSS·“财团”作为军事武器。真最后逃出了『财团』的魔掌,并且与“财团”的超级改造战士·豪岛展开生死战!