由于两位假面骑士的活跃，邪恶组织·杰鲁修卡被消灭，但是首领又创建了新组织·毒蝎帮(又译“迪斯特龙”)。本乡猛的学弟·风见志郎偶然目击毒蝎帮的行动，而受到该邪恶组织的追杀，之后父母以及妹妹都被毒蝎帮的怪人所杀。志郎为了向毒蝎帮军复仇而要求1号和2号替他改造，但二人知道改造人的悲哀，而拒绝了他。后来1号和2号落入了毒蝎帮的陷阱而陷入危机，志郎舍命相救，被机关所伤而奄奄一息，为了救他一命，1号、2号不得不将他改造成改造人·假面骑士V3。
故事发生在私立碧阳学园之中，这里的学生会成员，是凭借着学生们在学校的人气而选出的，这也就意味着，能够进入学生会的，都是在校园中超级受欢迎的美少女！杉崎键（近藤隆 配音）凭借着自己的努力和毅力最终当选了学生会副会长的职位，亦成为了学生会中唯一的一名男生，而他拼尽全力也要杀入学生会的理由，就是想让学生会的所有女生们都成为他的后宫。 娇小可爱的樱野栗梦（本多真梨子 配音）、成熟稳重的红叶知弦（美名 配音）、活力满满擅长运动的椎名深夏（富樫美铃 配音）、温文尔雅娇弱可怜的椎名真冬（野水伊织 配音），在这些女孩子们中间，杉崎键的日常会是怎样的面貌呢？
怀抱悔恨与自暴自弃的及川紫纹，为寻找人生终点而四处漂泊。最终他抵达了名为"尽果"的断崖之地，走进伫立在此的"玛古达拉屋"小餐馆。当店主玛丽亚端出热气腾腾的套餐后，因料理过于美味，紫纹不知不觉间已添了第二碗饭... 此后他暂时留在餐馆工作。在与玛丽亚、女掌柜怜子、渔夫克夫、以及同样追寻死亡之地的青年丸弧等人相遇的过程中，紫纹逐渐重拾生存的勇气。某日，玛丽亚突然从"尽果"消失... 原来这位始终带着笑容从容经营餐馆的女子，竟背负着惊人的秘密。
