由于两位假面骑士的活跃，邪恶组织·杰鲁修卡被消灭，但是首领又创建了新组织·毒蝎帮(又译“迪斯特龙”)。本乡猛的学弟·风见志郎偶然目击毒蝎帮的行动，而受到该邪恶组织的追杀，之后父母以及妹妹都被毒蝎帮的怪人所杀。志郎为了向毒蝎帮军复仇而要求1号和2号替他改造，但二人知道改造人的悲哀，而拒绝了他。后来1号和2号落入了毒蝎帮的陷阱而陷入危机，志郎舍命相救，被机关所伤而奄奄一息，为了救他一命，1号、2号不得不将他改造成改造人·假面骑士V3。
故事发生在名为美滨学园的私立寄宿制学校之中，高耸的墙壁和森严的制度让这所仅有五名学员的学校成为了与世隔绝的桃花源，某日，一位名为风见雄二（樱井孝宏 配音）的男生转学来到了这里，打破了此处维系多时的平衡，与此同时，雄二亦是学园中唯一的男性。 冷漠寡言的千金大小姐榊由美子（田中凉子 配音），大大咧咧毫无防备的周防天音（田口宏子 配音），傲娇毒舌的金发双马尾松岛满（水桥香织 配音），表面天真无邪实则神秘莫测的入巢莳菜（民安智惠 配音），温文尔雅却略微有些天然呆的小岭幸（清水爱 配音），在这些个性迥异的女孩子们的围绕下，雄二会迎来怎样的校园生活呢？
我开始能看见那个在意女孩的好感度了——。迟迟不敢向青梅竹马茉莉花告白、优柔寡断的北见彼方，对着流星许下了强烈的愿望。"希望能像恋爱游戏一样，看到对方的好感度啊~~~!!"结果从第二天开始，他的视野里就出现了浮现在班上女生们头顶的好感度计量表……!?虽然感到困惑，他还是怀着期待与不安确认了茉莉花酱的计量表，上面显示的，竟然是突破了底线、滴落着粘稠黑泥的坏掉了的好感度计量表——!?"茉莉花酱，明明讨厌我，为什么一直以来都对我那么温柔呢？"面对残酷的现实，他开始思考她至今为止言行背后的真相。究竟，"腹黑可爱"的茉莉花酱隐藏的真实想法是什么？她是真的讨厌主人公，还是计量表的显示藏着什么秘密？在计量表所指示的"地狱"尽头，等待着他们的真爱归宿究竟会是何方!?
充满神秘气息的古代土地“上津未原”，那是发生在比这个国家的历史还要早的从前的事……不现实的原定、痛彻心肺的感情，在这片不吉利却又美丽的土地上深深的扎根……以统治着上津未原的“桃歌台学园”和上津未原的豪门家族“守东家”的人们为中心展开了一段幻想奇妙的恋爱绘卷。
生徒たちからは、機嫌を損ねたら呪われる「こわこわ先生」と恐れられている新米教師の鶸村(ひわむら)ひより先生。……しかし、本当は体力0、声もヒョロヒョロ、あらゆるステータスが最弱なだけの「よわよわ先生」だった！鶸村先生の秘密を偶然知った担当クラスの阿比倉(あびくら)くんは、不器用な先生の頑張りが報われるよう、彼女に協力して生徒の誤解を解こうと決意。ドキドキで刺激的なトラブルに巻き込まれながら、大好きな鶸村先生をサポートしていく！よわよわで、かわいい先生との、ちょっぴり刺激的なラブコメディ、開幕!!
