由于两位假面骑士的活跃,邪恶组织·杰鲁修卡被消灭,但是首领又创建了新组织·毒蝎帮(又译“迪斯特龙”)。本乡猛的学弟·风见志郎偶然目击毒蝎帮的行动,而受到该邪恶组织的追杀,之后父母以及妹妹都被毒蝎帮的怪人所杀。志郎为了向毒蝎帮军复仇而要求1号和2号替他改造,但二人知道改造人的悲哀,而拒绝了他。后来1号和2号落入了毒蝎帮的陷阱而陷入危机,志郎舍命相救,被机关所伤而奄奄一息,为了救他一命,1号、2号不得不将他改造成改造人·假面骑士V3。
魅灵侵袭,古神大陆的安宁将如何守护? 本源之力,所得的生命之水遭八方觊觎…… 亲情与道义,安有两全抉择? 被构陷结魔,该如何挣脱囹圄? 林枫能否战胜魔尊分身,重塑魔尊封印,守护古神大陆安宁?