自那之后已经过去了5年。Amazon几乎被驱除，世界趋于和平。但是被Amazon细胞感染的普通人Amazon化的现象在持续发生扩大，为此政府组成了新组织4C，秘密驱除Amazon化的人类。 其中，幼年时期被Amazon养大的少年·千翼变身假面骑士Amazon Neo与Amazon战斗。但在被生来的吃人冲动所驱使的他的面前出现的是，变身为乌鸦Amazon并作为生物兵器战斗的少女·优。对于这样的优，他第一次没有产生“想吃”的想，并被她吸引着。而优的真面目是被Amazon化的父亲杀死后，作为Sigma型而复活的Amazon。
故事发生在一个幻想中的武侠世界，这个世界普通人可以通过不断习武修练内功，激发自身精神与身体上的潜能。故事主人公林辰，是一个出身平凡，追求习武巅峰的普通武者。他在遭遇不公对待后，愤怒之下触发自身精神上的潜能，进入了类似量子效应的“心觉”状态，却也因此目睹了家人在未来即将遭遇可怕的危险。因此，为了保护家人、爱人免遭致命侵害，以及调查父亲失踪谜案，林辰以一份神秘的名单为线索，追寻这一切背后的真相，并与邪派势力展开曲折艰险的斗争，谱写出一段可歌可泣的传奇故事。
原本还算有着可爱的脸蛋，可是不知为何总给人一种阴冷诡异不好接近的感觉。这便是刚刚升入高中不久的黑木智子（橘田いずみ 配音），她蓬头垢面，少言寡语，脸上是极度痴迷游戏后留下的黑眼圈。原本以为自己会成为乙女游戏中众星捧月的校花，谁知却注定要成为没有朋友、无人关注的丧女。更无法忍受的，是初中与之同类型的死党成濑优（花澤香菜 配音）都有了翻天覆地的变化。当然，拥有强大内心的智子绝不会因此自甘沉沦，她暗自嘲笑同学的肤浅与轻浮，在妄想世界里体会着前所未有的快乐。只不过依旧耐不住寂寞，这又化作了自卑、嫉妒和各种恶毒的心语。实在逼到极点，便朝向弟弟智贵（中村悠一 配音）。总之，她之所以变成这样，都怪这个世界和周围人而已…… 本片根据谷川ニコ的同名漫画改编。
内向的高中男生‧中村在入学典礼一眼爱上同班的广濑，鼓起勇气示好却常常失败。上素描课，广濑当模特儿，中村把握机会使劲地观察使劲地画，然而隔壁女生川村画得更美！于是自称是川村的粉丝，把她画的广濑素描画要走了…有一次中村和广濑一起放学，广濑遇到不良少年，中村挺身相救…在校外教学的时候，两人有了重大进展！？
