当还是很和平的时候,世界突然出现了一个企图侵略地球的邪恶军团“黑暗十字军”,地球受到无尽的威胁。在这时,联合国组成了一支地球保卫联盟的军队。这支军队被分配到不同角落,其中一支就处于日本。“黑暗十字军”开始在日本不同地区破坏。 日本各地,黑暗十字军各自选出目标,杀害反对他们的人。当大家都被杀害,其中五人奇迹生还并发誓会复仇。他们穿上特别的电子战衣,使用着普通人没法使用的超能力。指挥官告诉他们,他们是秘密的战士·“秘密战队五连者”。具有很好的机会去对抗十字军。
在艾伦他们居住的帕拉迪岛之外,还存在一个其他人类居住的世界。当中一个国家「玛雷」与其他各国爆发战争。陷入苦战之际,他们决定要攻进帕拉迪岛,把「始祖的巨人」抢过来。在这里又看到另一群孩子们拼命求生存的身影……。
回过神来,我只身一人站在地平线的中央。 环顾身边,没有任何的建筑物和人影。 束手无策地踱步之时,突然矗立在身后的「黄昏旅店」… 那是,存在于生与死之间的旅店。 为什么无法动弹? 为什么……是我? ――这是赌上性命的第二次比赛。