故事紧接着上一季，通过一场精心策划的大爆炸，沃尔特（布莱恩·科兰斯顿 Bryan Cranston 饰）终于除掉了长久以来的威胁古斯塔沃（吉安卡洛·埃斯珀西多 Giancarlo Esposito 饰），也将古斯塔沃一手建立的毒品帝国连根拔起。然而，“事业”上的成功并没有为沃尔特带来太多的快乐，因为他和妻子斯凯勒（安娜·古恩 Anna Gunn 饰）之间的关系再次跌落到了冰点。 古斯塔沃死了，但沃尔特的野心并没有消失，他联手杰西（亚伦·保尔 Aaron Paul 饰）与麦克（乔纳森·班克斯 Jonathan Banks 饰），开始建立属于他的新的帝国。一次偶然中，汉克（迪恩·诺里斯 Dean Norris 饰）在沃尔特家中发现了沃尔特就是海森堡的确凿证据，巨大的打击之下，他决心大义灭亲，昔日的连襟，如今沦为对手。与此同时，一股新的势力正在毒品圈内逐渐壮大，他们即将成为汉克最强大的敌人。
人头攒动、过往喧嚣的地铁站，一名衣衫褴褛的男子及其沉重的行李箱引起安检人员的警惕。经过一番追逐，男子声称行李箱内有炸弹，旋即引起莫大骚动。等到防暴警察赶来将其制服，却发现箱子内居然蜷缩着一具尸体。被捕男子名叫张超（宁理 饰），是江潭市小有名气的律师。他起先对罪行供认不讳，但随后拿出不在场证明当庭翻供。为此，经验丰富的刑警严良（廖凡 饰）火速加入专案组。未几，《江潭晚报》女记者张晓倩收到匿名信件，寄信人声称要玩一场关系本案的九宫格游戏。一时间，案情变得扑朔迷离，而随着调查的深入，严良也发现该案居然与多年前的一起案件息息相关…… 本片根据紫金陈的小说《长夜难明》改编。
爱新觉罗•溥仪（陈道明 饰），中国封建王朝历史上最后一个皇帝。三岁登基，时值动荡之秋，世间离乱。从最初的贵为天子、皇帝新婚大典，再到袁氏篡国、伪满建立，几十年间围绕着这位末代君主发生了无数勾心斗角和分散离合。溥仪一生经历太多无奈与悲哀，他既是时代的随波逐流者，也是历史流向的指引者。本片通过缜密的考证和精致的制作再现了这位末代皇帝从天子到平民的心路历程，伴随着他的人生经历，同时引领观众回顾了中国多灾多难的近代史。
高等法院暂委法官言惠知（佘诗曼 饰）正值事业高峰，但一宗案件令她人生逆转。为阻止社会出现更多“恶魔少年”，言官不惜放弃前途，主动降职担任少年法庭的裁判官。面对一宗又一宗严重的少年案件，她择善固执，坚持正义，也要救赎这些脱轨少年的人生。
故事发生在民国初期，廖思成（刘小锋 饰）和方天翼（张若昀 饰）是富商顾汉森收养的义子，两人和顾汉森的亲生女儿顾婷（吴婷 饰）一同长大，彼此之间情谊十分深厚。从黄埔军校毕业之后，廖思成前往日本深造，在此期间，他邂逅了美丽的日本女子大岛由美（章雯淇 饰），两人相知相恋，无奈九一八事变爆发，廖思成告别了爱人，回到了祖国。 那一边，勇敢聪慧的方天翼深受戴笠（吴秀波 饰）的喜爱和信赖，戴笠赋予了他“黑狐”的代号，隐藏在此假面之下，方天翼在顾婷和同僚俞梅（李曼 饰）的帮助下，同日本人和汉奸斗智斗勇，可实际上，俞梅和廖思成一样，是隶属于中国共产党的地下党员。
1992年，哈尔滨731陈列馆工作人员小金在整理史料时，发现这段历史的记录残缺不全，为寻找真相，他踏上了一场跨越数十年的跨国取证之旅，逐渐还原出那段被尘封的黑暗岁月真相。故事采取双时间线叙事，镜头回到日军侵华期间的哈尔滨，通过几个当事人的视角，深刻揭露日军731部队残酷的人体实验和泯灭人性的暴行，鞭笞日本军国主义的反人类本质，凸显中国人民坚韧的抗争精神。
