神秘组织·GOD看中了神敬太郎博士的人类工学技术,逼迫其加入,教授拒绝而遭袭击,儿子神敬介也被杀害,身受重伤的父亲为了让儿子复活,不顾自己的伤势,亲自执刀为儿子进行改造手术。敬介醒来后,父亲已死,透过计算机留言,敬介了解GOD欲危害世界的阴谋,于是背负起对抗邪恶的责任,成为第五号的假面骑士·假面骑士X。
古争锋本是守护神龙星的神龙,在上古与外星敌人的战斗中身受重伤故陷入了长久的沉睡。时光荏苒,再度苏醒的古争锋发现神龙星早已物是人非,而昔日受人敬仰的神龙也成了人们口中的恶龙,为了调查真相,也为了取回藏在龙王学院的宝藏,古争锋化为人形以导师的身份进入龙王学院,却阴差阳错地成为屠龙系的老师,为此古争锋一面悉心教授学员,一面努力找寻宝藏,几番调查下,古争锋发现龙王宝藏的知情人皆已离世,眼下唯一的线索可能在副院长夜江雪的手中。在接近夜江雪的过程中,古争锋多次出手协助,让夜江雪沉寂已久的内心泛起一丝涟漪,而与此同时,古争锋也被一股神秘力量盯上,躲避了多次暗杀行动后,古争锋感觉旧时的威胁正在逐步逼近,而找寻宝藏恢复力量,锻炼学员组成新的神龙军团抗击敌人迫在眉睫……