黑色四叶草

　　在浮世英寿成为守望世界的神明后过了一段时间，撕裂和平日常生活的一发枪弹与展露身影的变异种邪魔徒
　　这时候还没有人知道，这个邪魔徒的登场，是毁灭人类的元凶破坏神“God邪魔徒”诞生的前兆
　　然后在此出现的，是白发的英寿。他变身成绽放金色光辉的Geats，然后攻击Tycoon和Na-go等人。在一行人正困惑时，另一个英寿的身影出现了……
　　另一边，贝萝芭出现在吾妻道长的面前。因贝萝芭之手而让他体内沉睡的邪魔徒之力觉醒，所出现的充满不详气息的Buffa究竟是……？
　　「两个英寿」的存在所昭示的惊人事实是什么？
　　在破坏神的诞生分秒必争的当下，假面骑士们能否守护得住这个世界，守护得住人类呢？！

　　混杂于群众之中，以人类的肉为食。拥有人类的形态，却与人类不同的存在……“喰种”。
　　在对“喰种”进行驱逐、研究的“CCG”，曾经率领“Quinx”小组的喰种搜查官“佐佐木琲世”。他正是行踪不明的眼罩喰种“金木研”。
　　另一方面，在成立了新体制的“CCG”，以旧多二福为中心，不安定的行动终于表面化……
　　与“金木研”有关的故事，终于迈向最终章——。

　　TV2003重制版，是为庆祝EVA企业十周年而重置的版本，画面和音效都有提升。在TV95版的基础上重制了21-24四话重制的部分称作“Video”。加上原有的26集，03版共26话，一共30集。这个版本中21与22，23与24，25与26，27与28都是相同的内容。只不过21，23，25，27和原来一样，而22，24，26，28中增添了一些新的东西。
　　突袭世界的大灾难“第二次冲击”后，世界在废墟之上重建。14岁的少年碇真嗣被父亲碇元渡叫到第3新东京市。本以为能见到父亲迎接的他，却见到名为“ 使徒”的巨大生物与军队交火。危急之下，特务机关NERV的葛成美里将真嗣救下，并将其带往碇元渡所统领的NERV总部。但迎接真嗣的，却是是父亲冷酷地命令：驾驶称为“EVA”的巨大人型机器人与使徒战斗。本已表示拒绝的真嗣，看到重伤的替补驾驶员绫波丽后，决定遵从父亲的命令。就这样，从未受过作战训练的真嗣，准备驾驶EVA初号机迎战使徒。
　　不断袭来的使徒，身份不明的绫波丽，从德国来的驾驶员惣流·明日香·兰格蕾，14岁的少年要面对远超自己能力的挑战。而碇元渡不动声色地观察一切，一个称为“人类补完计划”的神秘计划正在按照他的计划实现。