混杂于群众之中，以人类的肉为食。 拥有人类的形态， 却与人类不同的存在……“喰种”。 对“喰种”进行驱逐、研究的CCG， 为了达成某个命题， 而新设了实验体集团。 ——其名为“Quinx”。 并非“正经人类”的他们， 与佐佐木琲世一等搜查官一起 在“东京”面对的事物究竟是——！？ 描绘《东京食尸鬼√A》2年后的新章《东京食尸鬼:re》终于启动。
当世界仍在从上一季的全球灾难中恢复之际，已发生变化的马克因内疚而痛苦不堪。他在全力保护家园和挚爱之人时，与一股强大的新威胁正面交锋，这股威胁足以永远改变人类的命运。
在很久以前，某座山中蛇精和蝎子精为害人间，它们的恶行引起天神震怒。天神用雷电化成的葫芦把两个妖精收了进去。葫芦化作葫芦山镇守两只妖精，只要满一万年，它们就会被葫芦化去。然而天运使然，就在九千九百九十九年之际，一只穿山甲无意钻破葫芦山，放出两只妖精。穿山甲带着老爷爷找到葫芦种子，只要种出七颗葫芦，便可将妖精重新收伏。 重新获得自由的蛇精和蝎子精无所顾忌，大肆残害生命。它们偶然得知老爷爷种出神葫芦，于是接连派出爪牙企图斩草除根。接连遭遇挫折的妖精转而绑架老爷爷，各具异能葫芦七兄弟相继出世，他们打向葫芦山，与狡猾的妖精展开正邪大战……
