机械帝国·黑岩浆企图征服世界，它利用高科技制造出一连串大灾害，并在联合国会议中向人类宣战。因此，联合国一致通过组建“太阳战队”的方案，让太阳战队与机械帝国黑岩浆对抗。
“信号塔大战”后，熊大、熊二和光头强的缩小器再度遗失。三人组合继续留守不夜城，找寻缩小器的回家之路更是状况频出，但他们从未放弃希望，最终与小动物们合力拯救小镇，呈现了一场精彩惊险的微观世界冒险之旅。
