悠利(早见沙织 配音)的父母在意外中不幸离世,这场悲剧让这个少年天真无邪的脸上平添了忧郁。一天,一个名叫凛凛澄(高桥李依 配音)的女仆突然出现在了悠利的面前,要认他做主人。 刚开始,来历不明身份成谜的凛凛澄让悠利十分的戒备,可随着时间的推移,凛凛澄所展现出来的高超家务技巧和极为出色的厨艺很快就征服了悠利,就这样,悠利和凛凛澄开始了居住在同一屋檐下的日子。他们之间奇怪的主仆关系吸引了千金大小姐五条院司(堀江由衣 配音)的注意,生性浪漫的她对于悠利和凛凛澄之间的关系充满了不切实际的幻想。
月落和亚晨是一对双胞胎兄妹,他们在一个与世隔绝的深山小村落里出生,被称为“分隔夜与昼的双子”。他们拥有获得特殊力量的资格,一场围绕他们的双使战斗也随之展开。双使是一种成对的存在,被人类冠以“幽灵”、“怪物”、“怪兽”或“异形”等各种各样的称呼。它们并非人人可见,各自拥有不同的外表、性格和能力。每对双使都有一个与之缔结契约的主子,而指挥它们的主子被称为“双使师”。许多大人在双胞兄妹开始懂事前就暗中操纵,试图夺取他们的力量,因此月落和亚晨在年幼时就被迫分离。本作故事以兄妹俩的重逢展开序幕。
混杂于群众之中,以人类的肉为食。 拥有人类的形态, 却与人类不同的存在……“喰种”。 对“喰种”进行驱逐、研究的CCG, 为了达成某个命题, 而新设了实验体集团。 ——其名为“Quinx”。 并非“正经人类”的他们, 与佐佐木琲世一等搜查官一起 在“东京”面对的事物究竟是——!? 描绘《东京食尸鬼√A》2年后的新章《东京食尸鬼:re》终于启动。