唐僧被妖怪捉走，剩下的孙悟空、猪八戒和沙僧却又因为信任危机而争执不休，一时间情况十分危急。原来，沙僧曾是误入歧途的半妖，却在千钧一发之际得到了降龙伏虎罗汉的点拨开悟，重回正道。如来佛祖将一项非常重要的任务交给沙僧，这项任务，便是暗中帮助西方之星石猴孙悟空。                                                                      　　一番波折之后，三兄弟总算解除了误会，并且追随着线索来到了异层空间，在这里，等待着他们的是强大的幽冥四天王，只有闯过他们所镇守的四煞宫，才能够打破结界，救回唐僧。然而，为了救回师父而英勇奋战的沙僧等人并不知道，他们已经落入了由太岁特种部队头目精心设下的圈套之中。

小潜艇阿力前往海底深处执行任务，遭遇史无前例的意外事件。小鲨鱼梅莎拒绝成为爸爸独眼鲨那样鱼见鱼怕的海底霸王，内心幻想成为小潜艇阿力一样的海底英雄。她无意之中得到的神秘宝盒，却把爸爸独眼鲨变回了童年的模样。当宝盒离奇失踪后，海底游乐场惊现神秘大怪物……                                                                      　　为探寻谜底拯救海底世界，小潜艇带着超萌小动物们一起踏上了神奇的寻宝冒险之旅。

本片讲述的是蝙蝠侠（罗杰·克雷格·史密斯 配音）以及罗宾联合正义联盟成员闪电侠以及绿箭侠一起对抗被称为Animilitia的犯罪组织。该犯罪组织都是由一些动物性的成员组成，包括银背大猩猩、猎豹女、杀手鳄鱼等，他们在高谭市作恶多端，一般警察对他们束手无策。而且该组织背后的主谋却指向蝙蝠侠的宿敌，同时也是高谭市叱吒风云的黑道大亨企鹅人（Dana Snyder 配音）。除了Animilitia组织，蝙蝠侠他们这次还要面对奥斯瓦德公司的商人新发明的邪恶网络动物机器人，一群犯罪恶势力再次聚集在高谭市。