华盛顿的一家酒店发生了爆炸，海军部长Clayton Jarvis当场身亡，国土安全部副主任Tom Morrow也身受重伤。在酒店外目睹了这一切的Parsons，似乎从中领悟到了什么。\n\nGibbs 《海军罪案调查处》第六季的首播集里，NCIS 团队调查了一名海军士官的谋杀案。伴随着喷溅的鲜血，一个被开膛破肚的海军上尉临死前用自己的血液写下了一个数字。在调查案件的同时，Gibbs 还要努力应对 V 讲述了海军罪案调查处专门从事秘密监视任务的分支部门OSP（特别项目办公室，Office of Special Project）打击高科技犯罪、逮捕最危险的罪犯并维护国家安全的故事。\n 加入该小组的 新任海军部长Clayton Jarvis交给了Tony一个关于微型芯片的秘密任务，并下令让他对NCIS探员Cade进行调查。Tony利用EJ找到了失踪的Cade，但神秘杀手Casey Stratton NCIS 的卧底特工 Nick Torres 在阿根廷执行任务时失联，他的姐姐 Lucia Campbell 少校前往阿根廷寻找他的下落。在回家途中，Lucia 乘坐的车辆被人安置了定时炸弹，她和女儿 Vance主任已经被绑架一个月了，Gibbs不得不暂代NCIS主任一职，而NCIS团队也继续在全球范围内寻找Vance的下落。成员们在新闻上发现了一条线索，Hakim团队挟持了Vance主任去抢劫银行 
