这次的故事从“声音”开始。高中生山吹有恓为了寻找初中时沉迷的电台主播而专注于声音。某天从学校广播中听到了确信是本人的声音。但是冲到广播室才发现有四个人在内,而且梦想也能对应上,为了找出真身告诉她自己的心意,有恓开始了行动。
故事发生在东京八丈岛近海,这里建成了一座连接了全球各地警方监控摄像的海洋设施“太平洋浮标”。在这座设施正式启动之前,为了与欧洲刑警组织管辖的范围联网,世界各国的IT工程师来到现场。而与此同时,一项应用了人脸识别系统的“新技术”的测试也在进行中…… 另一方面,柯南和少年侦探团在园子的招待下来到八丈岛赏鲸。此时,柯南接到来自冲矢昂(赤井秀一)的电话,被告知欧洲刑警组织的成员在德国遭到琴酒的杀害。为调查真相,柯南偷偷混进了前往“太平洋浮标”进行警备工作的黑田兵卫等警视厅人员乘坐的警备艇中,进入设施内部。之后,在为系统启动而稳步展开准备工作的设施内,发生了案件——一名女性工程遭到黑衣组织的绑架,而她手中装有某些情报的U盘也落到了黑衣组织的手里。 海中传来令人毛骨悚然的螺旋桨声。而此时身在八丈岛的灰原哀身边,也正有黑影在悄悄靠近……
她们不是人类。但是,比任何人都憧憬着人类对人间关系有心理阴影的奔三NEET:人间零。这样的我,刚想着要转职山清水秀的山区学校,过着优哉游哉的复健教师生活——那儿居然是为了让人外成为人类而设立的女校?!人鱼族水月镜花、狼人尾尾守一咲、兔子右左美彗、鸟羽根田帷……与这样不可思议的学生们渡过的日子。为什么想要成为人类,成为人类了想要干什么——我通过她们学习着“人类”。这既不是异世界奇幻,也不是转生人生重来。只不过是一所奇怪的学校,与向着成为人类努力的人外女子们一起渡过的,一位教师的故事。
高二的不良少年佐佐木与高一的腐男子宫野,坚决不走BL路线的男子高校日常生活(Boys Life),因为一起校内的纠纷促使两人结缘,之后两人的关系变得越发微妙......