故事发生在战国时代，普通人家出身的男孩猪名寺乱太郎祖辈曾是忍者，在父亲的劝说下，他离开家乡摄津，进入当时一流的忍者学园学习。在学校，他认识了与之同龄的新兵卫和雾丸。新兵卫是一个出身富商家庭的小胖子，为人迷迷糊糊，对吃尤为感兴趣；雾丸则是身世贫苦的孤儿，为人精明，贪财吝啬。这三个性格迥异却的小家伙成为好朋友，他们最大的共同点就是经常因为考试不及格受到处罚。当然，以校长大川平次涡正为首的老师们也都是性格古怪且鲜明的爆笑人物，乱太郎他们和周围的同学、老师一起上演了连番搞笑、有趣的精彩好戏…… 本片根据漫画家尼子騒兵衛原著《落第忍者乱太郎》改编，改编成动画时，因NHK电视台的禁忌而将“落第”二字去掉。
斋森美世虽出身异能者名门，却不像妹妹有珍稀的“见鬼之才”，从小遭父亲蔑视，并饱受继母和妹妹欺凌。斋森家为了政策联姻，将美世许配给异能者久堂清霞。此人虽才能卓越却性格冷酷，已被多任未婚妻解除婚约，美世初到久堂家时更只得到清霞冷淡对待，但善良的美世渐渐打动了漠然的婚约者。
天生残缺，孤注一掷，沈翔为打通灵脉身赴险地寻药，意外救下受伤的神魔二女，觉醒神脉。 守父亲，护家族，成一代丹神！
阿良良木历（神谷浩史 配音）正在为了即将到来的考试进行着刻苦的准备，一次偶然中，阿历发现镜子里竟然映不出自己的身影，惊慌失措的他找到了专门研究不思议事件的斧乃木余接（早见沙织 配音）和影缝余弦（白石凉子 配音），让阿历没有想到的是，两人竟然告诉他，他即将要变成吸血鬼了。 某日，一股邪恶的势力出现，阿历的两个妹妹火怜（喜多村英梨 配音）和月火（井口裕香 配音）遭到了绑架，同时失踪的还有独臂少女神原骏河（泽城美雪 配音），目的只有一个，那就是逼迫阿历就范。就这样，阿历和余接一起踏上了救援的旅途，最终，他能否抵抗命运，并且救回生命中重要的人们呢？
