TV2003重制版,是为庆祝EVA企业十周年而重置的版本,画面和音效都有提升。在TV95版的基础上重制了21-24四话重制的部分称作“Video”。加上原有的26集,03版共26话,一共30集。这个版本中21与22,23与24,25与26,27与28都是相同的内容。只不过21,23,25,27和原来一样,而22,24,26,28中增添了一些新的东西。 突袭世界的大灾难“第二次冲击”后,世界在废墟之上重建。14岁的少年碇真嗣被父亲碇元渡叫到第3新东京市。本以为能见到父亲迎接的他,却见到名为“ 使徒”的巨大生物与军队交火。危急之下,特务机关NERV的葛成美里将真嗣救下,并将其带往碇元渡所统领的NERV总部。但迎接真嗣的,却是是父亲冷酷地命令:驾驶称为“EVA”的巨大人型机器人与使徒战斗。本已表示拒绝的真嗣,看到重伤的替补驾驶员绫波丽后,决定遵从父亲的命令。就这样,从未受过作战训练的真嗣,准备驾驶EVA初号机迎战使徒。 不断袭来的使徒,身份不明的绫波丽,从德国来的驾驶员惣流·明日香·兰格蕾,14岁的少年要面对远超自己能力的挑战。而碇元渡不动声色地观察一切,一个称为“人类补完计划”的神秘计划正在按照他的计划实现。
电次是个背负了父亲遗留下的庞大债务,因此过着极端贫穷生活的少年,他救了恶魔啵奇塔,并与它一起以恶魔猎人的身份斩杀低阶恶魔来换取酬劳。有一天,流氓骗了电次,让他成为一堆恶魔的祭品,电次在临死之际,啵奇塔牺牲自己,把心脏给了他,让他复活并拥有了恶魔的力量,只要一拉位在心脏那边的链子就能发动。之后电次被公安人员看上,因此成为公安的恶魔猎人……