该剧改编自清闲丫头所著同名小说。故事延续第一部的剧情，讲述三法司少年团联手“攘外”，将一个个看似毫无关联的案件抽丝剥茧、扎根串联，护百姓安宁，更守家国平安的故事。
查向善（江美仪 饰）是一名全职母亲，看着两个可爱的女儿渐渐长大，对她们从生活到学习都严加管教，生怕一点疏忽造成不可挽回之错。无奈大女儿严茜瑜（江嘉敏 饰）并不明白母亲的一片苦心，压抑之中和母亲的关系十分紧张，父亲严夏（黄智贤 饰）又遭遇中年危机，最终夫妻两人感情破裂，虽然仍然住在同一屋檐下，却有名无实。 那边厢，查向善和家教会的另一名母亲袁圆（吕慧仪 饰）之间亦保持着针锋相对的关系，互相视对方为眼中钉肉中刺，所幸得到训导主任文嘉熙（陈敏之 饰）从中调解，方才化干戈为玉帛。然而，查向善发现严茜瑜竟然和文嘉熙的弟弟文亮熙（何广沛 饰）情投意合，她暗中和文嘉熙联手，希望拆散这对鸳鸯。
对于我们的三个主人公（一只小负鼠、一只刚孵化的鬣蜥和一只好斗的跳跳蛛）来说，在中美洲雨林中生存的噩梦从它们发现丛林深处的一个废弃实验室后迅速升级。不知不觉中，他们迷失在这个非自然的迷宫中，每个角落都隐藏着新的怪物，为了在为时已晚之前逃出去，他们展开了生命的搏斗。
1945年，艰苦卓绝的抗日战争取得伟大胜利，中国在和平与战争、光明与黑暗等重大问题上，面临艰难抉择。以毛泽东、周恩来、朱德、刘少奇为首的中国共产党人，以人民为中心，与以蒋介石为首的国民党独裁者展开大决战。毛泽东以大无畏气概，孤身涉险赴重庆谈判，指挥解放军抢占东北、转战陕北、发起三大战役、进行土地革命，发布“五一口号”。中国共产党的政策，赢得广大人民群众和民主党派的欢迎拥护，最终战胜了蒋介石王朝。1949年10月1日，中华人民共和国宣告成立。
生逢乱世的古平原（陈晓饰）因蒙受冤屈而遭流放宁古塔，他在夹缝中生存却又逆风翻盘，从文弱书生到茶叶发家、以盐立业，再到团结各地商帮力量联手救国救民，完成了从流犯到商界巨擘的逆袭。在成为“商王”的热血奋斗过程中，古平原与常玉儿（孙千饰）、李钦（罗一舟饰）、常四（成泰燊饰）、李万堂（黄志忠饰）、苏紫轩（李纯饰）、李成（朱亚文饰）、白依梅（向涵之饰）、王天贵（吴樾饰）等人相识，共同塑造出了一群复杂立体、有血有肉的晚清传奇群像。
