三剑客成功拯救完水果世界后，由于在花果山大合唱庆祝胜利造成第七层的崩塌，直接伤害到七色彩莲。为求保住彩莲，东方求败被外人蛊惑利用，接受了人类世界的忍术和其他技术去抢救彩莲，但同时也成为了拐带水果们的帮凶。方丈与果姥上山探望东方求败，无意间看出当中端倪，东方求败有灭口之意。三剑客赶到之时，方丈与果姥为保存实力，不单一个装疯扮傻，一个诈死，还出狠招将三剑客打落悬崖，并且疯言疯语，让众人误会三剑客，促使三剑客再无立足之地，必须远走他乡，从而避开东方求败的迫害。 三剑客在小果叮的帮助下捡回一命，重拾斗志誓要查出真相。在小果叮的指示下，各人各尽所长，千方百计寻找莲珠。历经重重苦难，并的机甲在莲珠的洗礼下得到重生，三人不断提升自我，获得新的技能和必杀技，对方也得到力量加强和武器升级，尤其是加上神鬼莫测的忍术，三人多次陷入苦战。三剑客屡败屡战，在失败中成长，反败为胜。女特攻们同样自强不息，一样创出新的招数和技能必杀，来支援三剑客。众人在花果山汇合，迎来与东方求败的终极一战。几经艰辛终于获得胜利，但东方求败的失败并不意味事情结束。 果宝们几经艰辛，终于来到第七层。真正的幕后黑手是外来人类龟太公。单凭众人之力并不足以抗衡。这时，养精蓄锐的老特攻们及时出手，2代特攻通力合作与龟太公周旋。这正正便是方丈和果佬计划好的联合作战计划。在敌我实力悬殊下，众果宝特攻突破自我，进化成黄金7合体，与龟太公决一死战。
在一个阳光明媚的日子里，五大国最强的火之国木叶村举行了运动会，据说获胜者将获得前往琉球度假的机会。漩涡鸣人（竹内顺子 配音）、小樱（中村千绘 配音）和宇智波佐助（杉山纪彰 配音）组成一组，他们摩拳擦掌，志在必得。谁知就在比赛开始前，鸣人突然感到腹中疼痛，他连忙离开会场跑去厕所，而男厕所门口前居然排起了长龙，他没有办法只能硬憋着返回会场，如此折磨的情况下比赛效果自然好不到哪去。总算混下来第一场，鸣人再度跑去厕所，偏偏此时男厕在打扫卫生，鸣人走投无路，想溜进女厕所，关键时刻又被雏田叫住。 接二连三的磨难，鸣人能否赢得前往琉球的机会？
艾伦为了毁灭世界，发动了「地鸣」。无数的巨人开始进攻，摧毁一切。米卡莎、阿尔敏、让、康尼、汉吉、莱纳、安妮、皮克，以及身受重伤的利威尔……剩下的人们为了阻止艾伦，展开了最后的战斗。
