伊莉雅是一個就讀穗群原學園的普通女孩,有一天被萬花筒之杖的人工天然精靈「魔法紅寶石」強制締結契約,成為「魔法少女伊莉雅」。她在萬花筒之杖前任持有者遠坂凜的命令下,開始被迫幫忙回收階級卡片……
主人公方寒在经历了残酷的仙魔斗争、同门的尔虞我诈、挚爱红怡牺牲之后,内心逐渐从懵懂少年成长为沉着果决的男人。