幸存者们发现岛上存在神秘建筑入口，在杰克（马修·福克斯 Matthew Fox 饰）的带领下进行探索，强制进入舱门后，发现里面竟然有人，且是杰克曾经在现实中有过一面之缘的戴斯蒙德（亨利·伊恩·库斯科 Henry Ian Cusick 饰），如同看到救星一般，戴斯蒙德留下一串数字密码便跑掉了，而杰克一行则需要接替他的任务——每隔108分钟输入密码以关掉警报。在舱门中，幸存者们找到充足食物，也由一卷录影带了解到这座孤岛的背景，似乎和某个失败的实验有关。另一方面，扎起竹筏试图离开岛屿的迈克尔（哈罗·佩里纽 Harold Perrineau 饰）等人并没有成功驶向深海，而是被潮水带到岛的另一边，发现还有一群机尾的幸存者，他们挟持着迈克尔等人慢慢向营地靠近……
来自400年后未来的高性能安卓时泽艾塔（宫馆凉太 饰）被传送到现代，任务是保护被不明势力盯上的少女漫画编辑神尾胡桃（臼田麻美 饰）。毫不知情的胡桃正因工作调动与生活压力而焦头烂额，艾塔则暗中监视、分析她，甚至以新人兼职身份潜入她的编辑部。言行完全不像人类的艾塔让胡桃困惑不已，但在她遭遇重大危机时，艾塔以超乎想象的方式出手相救，两人也因此开始同住一个屋檐下。随着相处加深，拼命守护她的艾塔让胡桃逐渐心动，而本不具备“恋爱程序”的艾塔也开始产生异常情感。在守护任务与逐渐萌生的感情之间，一段跨越人类与安卓的科幻恋爱喜剧由此展开。
