这是和数个怪异交织在一起的微不足道的友情和别离的故事。 返老还童的怪异“月读的变若水”，绝对不能读出声来的“异界之歌”， 来路不明的书不知不觉间排列在书架上“逆偷盗的本”， 神隐的实况记录报告“仙境异闻”···首都范围内的某个中心车站， 这个小镇究竟在发生著什么…… 残留在令和世上最后的迷宫， “现代怪异”的mystery 志愿成为不足为道的小说家， 绪川董子和搭档的童颜细目的魔少年化野莲发起了挑战! 追求的是超自然知识和体力的胜负。 在解开这个小镇涌现出的数个怪异的二人前方等待的是…
不久的未来，人类的世界早已拥挤不堪，迈向星河、寻找新家园的行动迫在眉捷。正当一切有条不紊的推进之时，月相异动，脚下的大地爆发了长达数十年、剧烈的地质变化，人类在这场浩劫中所剩无几。当天地逐渐恢复平静，人们从废墟和深渊中重新踏上了这片熟悉而又陌生的大地。习惯了主宰一切的我们是否还是这个世界的主人？
修真奇才王令身怀足以颠覆世界的能力，却只想过普通人的平静生活。阴差阳错进入六十门修真学园精英班的他结识了一众同学，在灵剑大赛上挫败了杀手组织“影流”的计划，收获友谊的王令决定继续用自己的力量守护这平静的日常。然而事情真会如他所愿吗？
第四次非核大战一年后的2027 年，在还留有战争痕迹的新滨市，发生一起疑似收贿的军人遭到枪杀的案件。雨幕中，公安‧荒卷大辅为了找寻军人的电子脑而潜入墓地，却遭到想证明上司清白的草薙素子持枪抵住身后。但是，追查这起案件的并非只有草薙一人，拥有「不眠之眼」的巴特怀疑她就是爆破杀伤事件的犯人，因而紧咬着不放；以及正持续追查枪击案与娼妓命案间共通点的新滨县的刑警‧德古沙。此外，「501 机关」的徕津中佐也正注视着草薙的行动。为了寻找自身的未来与理想，草薙的本能将自此觉醒（ARISE）……。
