故事舞台是在机动战士高达中的一年战争终结后七年。战争结束后一部份吉恩公国军事势力并未降伏继续在各地与地球联邦军发生军事冲突，因此地球联邦军内部强力主张追杀吉恩残余份子的激进排他势力泰坦斯（Titans）结成。由于泰坦斯对宇宙住民的强硬血腥镇压的手段，反势力奥干A.E.U.G.(台湾翻译为奥干，港译为奥古)结成。故事的开始于宇宙世纪0087年（U.C. 0087），前半主要围绕奥干和泰坦斯两派系的对抗，中段吉恩残余份子上阿克西斯(港译为阿古捷斯)登场，与奥干、泰坦斯角力周周旋，展开激战。
桐生慧辉（下野纮 配音）是一个平凡的高中二年级男生，虽然也憧憬着高中校园里甜甜的恋爱，但是这样的恋爱似乎和他无缘。一天，慧辉终于收到一封梦寐以求的情书，然而让他没有想到的是，从信封里竟然掉出了一条白色内裤，难道，寄出这封情书的女孩是一个变态？更糟糕的是，这封情书并没有署名，这也就意味着，活跃在慧辉身边的所有女孩子，都有可能是这封情书的作者。 看似高高在上实际上是一个受虐狂的朱鹭原纱雪（竹达彩奈 配音）、外表乖巧可爱但是个性却超级恶劣的古贺唯花（日高里菜 配音）、名为漫画家却只画BL漫画的南条真绪（野水伊织 配音），那封情书的作者究竟是谁呢？
黑暗梦魇，有增无减。务必认清，敌人的真面目……
