在火星发现的神秘箱子――“潘多拉魔盒”打开的瞬间，巨大的墙壁突然出现！故事由此开始。被称为“天空之墙”的墙壁把日本列岛分割为三部分，并由此诞生了各自的首都「东都」「西都」「北都」。 其中在“东都”有被称为Smash的未确认生命体出现并暗中把人类逼入绝境。挡在Smash面前而出现的，是一位青年，其腰上戴着腰带、 手上握着不可思议的瓶子 。「变身！」―― 青年天才物理学者变身为假面骑士Build，阻挡在Smash的面前！
故事讲述男主角大山武进入了原本是女校的大日学园，在这间女性的花园的学校里，等着大山武的是能干的青梅竹马兼学生会副会长的女主角天谷春恋、高傲的大小姐姫神木灵及非常可爱的未婚妻栉八稻穗。
冈田猛男（江口拓也 配音）是集英高中一年级的学生，隶属于柔道部，他生得人高马大五大三粗，却因为善良率真的个性而深得同伴们的喜爱和信赖。砂川诚（岛崎信长 配音）是猛男青梅竹马的好友，外表英俊帅气的他很受女孩子的欢迎，从小到大，凡是猛男喜欢上的女孩，最后总会被阿诚吸引，久而久之，猛男竟然也习以为常。 一次偶然中，猛男将一位名叫大和凛子（潘惠美 配音）的可爱女孩从电车痴汉手中救下，温柔可爱的凛子一下子击中了猛男的死穴，但猛男认为凛子喜欢的应该是阿诚那样的类型。让猛男没有想到的是，凛子喜欢的竟然正是强壮的猛男，阿诚得知了凛子的心意后开始积极地在两人之间牵线搭桥起来。
