机动战士高达SEED的系列作再开。这次除了我们大家熟悉的基拉（保志总一朗 配音）、阿斯兰（石田彰 配音）等人外，还有大量新角色的登场。而故事也将演变的更为复杂，冲突加剧，战争升级。 C.E.70年2月，“血染情人节”事件的辐射效应还在地球联合军和ZAFT中延续着。二者发动了数次对抗，伤及众多无辜百姓。C.E.71年6月，地球联合军居然不顾条约发动了对中立国家奥布联合酋长国的侵略。这让少年真飞鸟（铃村健一 配音）在一瞬间失去了自己全部的亲人，而且都是在自己眼前。这件事对飞鸟的打击不小，让他这个无忧无虑的平凡少年，决定加入ZAFT。加入ZAFT，飞鸟遇到了许多挫折和坎坷，也看到了人性的残忍和无奈，最严峻的情况是自己内心始终笼罩着家人离去的阴影。飞鸟的成长在ZAFT正式开始。他和基拉、阿斯兰他们又会有怎样的交集呢？
他们来自一个一切都颠倒的平行宇宙：瓢虫和黑猫的拥有者，暗影瓢虫（ShadyBug）和黑爪（Claw Noir），是恶棍，而蝴蝶的拥有者，赫斯佩利亚（Hesperia），是一个超级英雄。瓢虫（Ladybug）和黑猫（Cat Noir）将不得不帮助赫斯佩利亚抵御他们邪恶的双胞胎的攻击，并阻止他们夺取蝴蝶奇迹（Butterfly Miraculous）。我们的英雄们能否也帮助赫斯佩利亚并让暗影瓢虫和黑爪成为更好的人呢？
