故事设定在一个身怀魔力的人类濒临灭绝的世界，武力的最高境界从使用利剑，转而到使用魔法，继而变成了使用枪械。就读于培训用以取缔残存魔力威胁的“异端审问官”专业机关——“对魔导学园”的男主角草薙哮，是个完全不会使用枪械，只靠一柄刀与敌人交锋的另类。而他率领的第35试验小队又被称为“杂鱼小队”，顾名思义是由一群劣等生拼凑而成的团队。某一天，拥有“魔女猎人”资格的超精英持枪高手凤樱花，竟然加入了这支队伍。在带领队员动身执行回收魔导遗产的任务中，一场学园动作奇幻大作就此开始。
“想洗清嫌疑，方法有很多，语言辩解只是其中的一种，但也是最无力的一种。实力也是一种辩解的方法！”紫川秀，这位在魔族大营内孤身击杀紫川家叛徒的将领，在远东地区神秘圣庙守护长老的支持下，成为了远东地区数十万联合部队的首领。一位新的远东之王——光明王，诞生了！
故事將圍繞綠谷出久與死柄木弔的對峙、轟焦凍與其兄轟燈矢了斷家族恩怨，以及麗日御茶子與渡我被身子的相遇展開，同時也將迎來歐爾麥特與「人人為我」的戰鬥結局。
猪猪侠说他自己曾经进入时空隧道，回到了208年的奥林匹斯小岛。迷糊博士觉得事情的可信度很高，于是决定研究大钻石的神奇力量，希望可以回到208年的世界去看个究竟。迷糊博士把大钻石装在了一台时间机器上，并找来猪猪侠帮忙实验。然而在混乱当中，迷糊把时间机器的时空坐标调到了2080年，结果一不小心，把猪猪侠给传送到了未来的世界。在未来的世界里，科学技术的发展可谓一日千里，各种体育运动项目也是借助高科技的产品进行的。这时，破旧不堪的望子成龙小学由于经费不足的问题，面临停学危机，波比等...
