主修電腦工程的秋尚宇律己甚嚴，在一堂通識課中認識了設計系的張宰英，是校園風雲人物的張宰英可謂十項全能，卻只對秋尚宇無能為力......。張宰英在完美主義的秋尚宇面前，就像程式中錯誤的語意，秋尚宇能否編好這程式錯誤呢？
一心想成为幽灵猎人的天空寺尊于18岁生日时，收到来自十年前亡父生前所寄的幽灵眼魂（Ghost Eyecon）后，来自异世界的怪人——眼魔突如其来地出现在面前并盯上此物，甚至为救青梅竹马月村明里和御成而身亡。得到仙人的帮助之下而获得Ghost驱动器变身，成为假面骑士Ghost并得以九十九日短暂的生命复苏。为收集实现复活愿望的「15位伟人」眼魂，投身于影响世界命运的战斗中。
