从人类的思想和感情诞生的「e-脉冲」,被作为AI辅助装置「辅助蛋」的能量源被运用。 在社会获得显著发展的背后,恐怖的怪物出现了。 吞食e-脉冲进化的生命体「数码兽」。
因兴趣而开始做英雄的男人,埼玉。他通过3年的特训获得了无敌的力量,成为仅凭一击就能打倒任何敌人的英雄。他和偶然成为自己弟子的杰诺斯一起,开始在英雄协会正式展开英雄活动。在怪人发生率异常上升的同时,英雄协会想到大预言家皱巴巴婆婆留下的“地球完蛋了”的灾害的可能性,并准备开始研究对策。此时,对怪人感到憧憬的饿狼出现了。
罗刹街镇魂将曹焱兵和寄灵人夏玲踏上修复灵槐之路,羽林街镇魂将南御夫却受命缉拿曹焱兵,恰有菩提街镇魂将北落师门出面平息事态。但南御夫心怀鬼胎,北落师门与女孩水儿也暗藏秘密,曹焱兵和夏玲又将如何应对。菩提树下,三方命运交结,最终会涌至何处?
21世纪,地球回复昔日的和平,但此时宇宙坠下一颗陨石,陨石有一个人工的时空囊。地球和平联盟TPC的GUTS小队通过时空囊了解到地球将有大灾难发生。而此时,时空囊预言的两大怪兽·“哥路渣”和“米路巴”先后出现,GUTS小队便根据预言寻找收藏在金字塔的三大巨人的身体。 几经寻找后GUTS队员们终于找到金字塔,但两大怪兽也到来了。虽GUTS拼死守护,但三个巨像已被破坏剩一个,队员·大伍的战机也被击中,且逃生装置失灵。在危急关头,大伍突然化成光,和最后一个的石像结合。光之巨人“迪加”因此而复活,并与两大怪兽展开了战斗……