《神探狄仁杰3》分为《凉州案-黑衣社》和《邗沟案-漕渠魅影》两个惊险绝伦、触目惊心的故事组成。故事承接第二部，狄仁杰（梁冠华饰）自连破幽州、并州、蛇灵、江州等一系列大案后，几经恳请，终于得武皇（吕中饰）允准回老家并州修养。然而就像护卫李元芳（张子健饰）所言，这看似颐养天年的平静中却蕴藏着更大的杀机与阴谋。本部历史侦探悬疑系列电视剧《神探狄仁杰》，已有四部推出，部部故事悬念迭出，情节扣人心弦，《神探狄仁杰5》也即将在2014与观众见面。《神探狄仁杰》系列电视剧不仅融合扑朔迷离的悬疑剧情与恐怖的视觉
“九一八”事变，国民党撤出华北，国民党高级军官金戈（王雷 饰）冒死回到东安城内，想要接走自己的母亲和新婚妻子柳文婷（张曦文 饰）。但日军已然进城，柳文婷被逼自尽，金戈被抓。地下工作者救出金戈，希望他能前往根据地，运用自己的军事知识与八路军共同抗日。然而金戈对八路军的作战能力持怀疑态度，他选择独自留在东安城附近杀鬼子。一次偶然的不打不相识，金戈遇到了敌后抗日游击队队长戴金花（王媛可 饰），与他们一起击退了鬼子。从最初的互相看不上眼，到一起浴血奋战，金戈从戴金花身上看到了真正的抗日精神。他们成为一支活跃在敌后的抗日武装，极大地牵制了龟井一郎（山崎敬一 饰）的军事力量。1945年，日军在各个战场上节节败退，龟井想要在东安城实施“死海”计划，全城百姓生命安危悬于一线，金戈与金花带领队员潜入东安城，最终成功制止了“死海”计划，共同迎来了抗日胜利的曙光。
故事发生在宋金年间，道教侯任掌门天生（关礼杰 饰）和程若诗（周慧敏 饰）两情相悦，若诗的腹中更是有了天生的骨肉，两人想要隐居古墓，逃离江湖纷争。天生的师兄玄生（林尚武 饰）觊觎九阴真经，勾结金人企图造反，逼得天生出山，与之势不两立。争斗之中，玄生劫持了若诗母子，最终，为了保护家人，天生不幸遇难，临死前，他将儿子托付给了师兄黄裳（黎汉持 饰）。 一晃眼20年过去，天生的儿子（郑伊健 饰）业已长大成人，某日，他遇见了名为完颜峯（罗嘉良 饰）的金人，趣味相投的两人结为兄弟，天生的儿子亦得名重阳。偶然机会下，王重阳救了一名名为林朝英（梁艺龄 饰）的女子，谁知该女子一心要杀王重阳的义父黄裳报仇，而二人日久生情却误会重重，爱恨纠缠。随着时间的推移，重阳也渐渐得知了自己的身世，他决心替父母报仇。
