甚至连小差错也要酷酷地去做的惹人爱的男孩子们。虽然是很Cool、让人感觉有些难以接近，却又非常帅气的男孩子们。但是他们……全员都是冒失鬼！正是因为冒失，所以感觉没有距离感。正是因为冒失所以才可爱。
内向的高中男生‧中村在入学典礼一眼爱上同班的广濑，鼓起勇气示好却常常失败。上素描课，广濑当模特儿，中村把握机会使劲地观察使劲地画，然而隔壁女生川村画得更美！于是自称是川村的粉丝，把她画的广濑素描画要走了…有一次中村和广濑一起放学，广濑遇到不良少年，中村挺身相救…在校外教学的时候，两人有了重大进展！？
牙鬼との激闘から2年、それぞれの夢に向かって旅立った6人は好天の三回忌をきっかけに再び忍術道場に集まった。そこへ突如現れた牙鬼の残党を相手にお互い成長した姿を見せ合うように妖怪を倒していく天晴達。中でもガシャドクロを生身で倒してしまう風花と霞の成長に驚く一同。なんとこの2年、2人は強さと人気を兼ね備えたアイドル忍者“ニンニンガールズ"として平和を守っていたのだった! 戦いを終え久々の再会を喜ぶ6人の前に「久しぶりね天晴」とまさかの人物、天晴と風花の母・桜子が現れた。しかも風花と霞を誘い“ニンニンガールズ"をプロデュースしているというのだ。さらに世界進出を考える桜子から“伊賀崎流"の名前をかけて“ニンニンガールズ"と真剣勝負を提案される天晴、八雲、凪、キンジの4人は“ニンニンボーイズ"として受けて立つこととなった。この試合もアピールの場として使おうとする桜子は、新メンバー・九重ルナの加入をサプライズ発表。さらにミドニンジャーシュリケンを勝手に与える暴走っぷり。そして数合わせとして旋風も加わり4対4の真剣勝負が始まった。 時を同じくして、執念の復活を遂げた有明の方が萬月の復活と、真剣勝負を利用したニンニンジャーの分裂を企て暗躍を開始する――。 果たしてニンニンジャーは再び世界の平和を守ることが出来るのか! ?
