在原本是平凡生活中的一天,整个世界发生了异变,床主市街上出现大量如同丧尸般的死体,而主角小室孝所就读藤美学园的也遭到死体的袭击。为了求生小室孝集结了包含青梅竹马在内的一批人,在这如同地狱般世界中,过去的各种价值观及法律已毫无意义,为了能在这现实的世界存活下去,人们的自私、黑暗、疯狂开始渐渐浮现,而主角一行人必须抛弃从前所谓的理想,面对残酷的现实,并在这崩坏的世界求得一线生机…
由于两位假面骑士的活跃,邪恶组织·杰鲁修卡被消灭,但是首领又创建了新组织·毒蝎帮(又译“迪斯特龙”)。本乡猛的学弟·风见志郎偶然目击毒蝎帮的行动,而受到该邪恶组织的追杀,之后父母以及妹妹都被毒蝎帮的怪人所杀。志郎为了向毒蝎帮军复仇而要求1号和2号替他改造,但二人知道改造人的悲哀,而拒绝了他。后来1号和2号落入了毒蝎帮的陷阱而陷入危机,志郎舍命相救,被机关所伤而奄奄一息,为了救他一命,1号、2号不得不将他改造成改造人·假面骑士V3。