佐伯丽奈（原奈津子 配音）是一名平凡的高中二年级女生，个性十分开朗活泼的她对世间的一切都充满了浓重的好奇心。朝比奈凉香（藤田奈央 配音）是丽奈的同班同学，一头利落短发的她，性格像男孩一样大大咧咧，不仅运动神经非常发达，成绩也常年霸占年级第一名的宝座。五十岚琉璃子（徳井青空 配音）是丽奈青梅竹马的玩伴，沉默寡言时常放空自己的她实际上拥有超强的灵感力，常常能看见别人看不见的东西。 故事围绕着三个女孩展开，她们利用超市里非常常见的廉价食材，却做出了能够让人感受到温暖的美味料理。
在灵气复苏、全民修真的蓝星，李凡尘为替父亲偿还一亿高利贷，被迫进入峨眉女子学院。初入校园，他以未知层级的炼气期修为遭人嘲笑，却意外与南宫珩结下渊源。炼丹大赛上，他用大铁锅炼出九转造化丹惊艳全场，不仅赢得比赛，更让对手履约道歉；青云森林的狩猎任务中，他误惹雷狱麒麟又逢尸骨大阵，凭借神兽威慑化险为夷；面对魔教金苍的突袭，他手持锄头秒杀强敌，却没能阻止南宫珩被教主掳走。最终，李凡尘选择留在学院坚守正邪战局，成为峨眉女子学院史上首位大师兄，开启全新修真之路。
青城山灭派，玄门遭遇旷世劫难。朱离地煞觉醒，携青城掌教冷霜凝险夺玄珠，再顾青玉坛，蒙星象子指点，欲共赴昆仑抵御魔道大军。天一子未赴中秋之约，太白子知道天一子已遇不测，开始查探凶手，本以为是魔道的阴谋，没想到在昆仑派发现了一些端倪。魔道势力风谲云诡，其间隐情扑朔迷离，深不可测的魔道高人邓辰因为太初九元的转世，重出天阴谷，纠集紫衣人等魔道长老集齐三才秘要，欲救出魔道祖师天魔元煞，登顶昆仑之时，幕后黑手阴谋乍现，玄魔两派均遭扫荡。玄魔两派，孰正孰邪，灵飞纪第三季为您揭开面纱。
