故事紧接着上一季，金钱的紧缺和癌症的侵袭都不再是沃尔特（布莱恩·科兰斯顿 Bryan Cranston 饰）将要面对的难解问题了，家庭的濒临破碎才是让沃尔特感到心痛的真正原因所在。由于妻子斯凯勒（安娜·古恩 Anna Gunn 饰）坚定的离婚决心，沃尔特从家中搬出，搬入了新的居所，这也为他和大毒枭古斯（吉安卡洛·埃斯珀西多 Giancarlo Esposito 饰）之间的合作创造了有利的条件。 为了替死去的图可（雷蒙德·克鲁兹 Raymond Cruz 饰）报仇，两位冷面杀手找到了汉克（迪恩·诺里斯 Dean Norris 饰），激烈的交锋后，汉克身负重伤。面对着逐渐失控的一切，沃尔特感到了前所未有的危机，尤其是他的新搭档盖尔（大卫·科斯塔贝尔 David Costabile 饰），沃尔特明白，一旦盖尔掌握了他独创的制毒技术，自己将很快被古斯除掉。
曾经朝气蓬勃的国营大厂旭 日厂内，一具断 足女 尸被意外发现丢弃在废弃的排污水池中，死者是厂职工子女沈小舟。刑警组长连海平奉命侦查此案，第一天报道的年轻刑警石强锋意外分到连海平手下，意外的案件，意外的组合，开启了一段三人之间的宿命缉凶之行。 同时，这起案件也勾起连海平记忆深处一段不为人知的过往，而新搭档石强峰来到他身边似乎也怀揣着自己的秘密。在调查过程中，连海平警觉地发现有一股势力在刻意引导着警方的调查方向。 身世神秘的搭档、意外死 亡的初恋、城府深沉的企业家、日暮穷途的旧厂区······这起案件连接了过去与未来的真相，迷雾似见光明，暗潮早已涌动。
以戏说的角度，讲述了康熙年间，由于长年黄河泛滥，康熙帝（张国立 饰）为了体恤民情，亲自下江南考察，由此引出了一出出颇为传奇的故事。第一部由《犁头记》、《铜鼎记》、《八宝粥记》、《紫砂记》这四个故事构成。 《犁头记》：五莲县县令罗世长私分库中税粮一事引起了康熙的重视，而这起事件背后则是灾民不断，忠臣隐瞒不报的事实，于是康熙帝决定自己亲自出马；《铜鼎记》：一次意外，康熙帝撞上了偷铜鼎瓶的小太监，小太监居然咬舌自杀，这背后的蹊跷牵扯出一个庞大的关系链，让康熙帝大感吃惊；《八宝粥记》：康熙帝微服出巡来到了苏州，发现一家粥店的老板把牌匾换了，“粥”字中间少了“米”这个字。康熙帝知道了苏州并不太平，为了调查此事，康熙帝买下了粥店，亲自当起了老板；《紫砂记》：外国大臣南怀仁不小心把一个紫砂壶打破了，意外看到了紫砂壶碎片上刻有几行文字，而这几行文字内含有冤情……
