郭靖（梁家仁 饰）和黄蓉（欧阳佩珊 饰）遇见了年幼便失去了双亲的杨过（刘德华 饰），可怜他孤苦伶仃的身世，侠肝义胆的夫妇两人收留了杨过，将他带回桃花岛，苦心调教。随着时间的推移，杨过渐渐长大，然而此人个性十分顽劣，又倔强不听劝导，但却有着极高的武学天赋，于是，郭靖将他送往了重阳宫，希望他能够在那里接受教化。 然而，杨过却依然我行我素，肆意妄为。一次偶然中，杨过闯入了教规明令禁止进入的后山，在那里遇见了孙婆婆，又被恍如天人的小龙女（陈玉莲 饰）收为徒弟，传授给他了古墓派绝学。渐渐的，杨过和小龙女之间产生了真挚的情谊，然而，这段感情却必定要遭受非议和风雨。
故事从传说中的夸克族与暗黑族开始延伸。善良与邪恶形成两势力对抗，加入萌学园里的萌骑士团结在一起保护结界。萌学园里的魔法预言书蕴藏着什麼天大的秘密？奈亚公主及忧伤艾瑞克纯纯的情愫正在发酵，误闯萌学园的坚尼，会为萌骑士团带来什么冲击？颠覆你对魔幻世界的想像力，一起探索萌学园体验奇幻旅程。
35世纪的今天，千年前曾在人间的变异族群被人类击败后，统一关押在地核成为地界人。近年来，随着地接牢笼封印的松动，屡有地界人逃到人间，利用自身异能作案。龙城建立了特别调查处，与地界管理者黑袍使合作，专门打击异能犯罪。吊儿郎当的年轻处长赵云澜走马上任，开拓了全新的局面。
东胜神州的傲来国花果山的一块巨石孕育出了一只明灵石猴（六小龄童 饰），石猴后来拜须菩提为师后习得了七十二变，具有了通天本领，于是占山为王，自称齐天大圣。玉帝派太白金星下凡招安大圣上了天庭，后来大圣因为嫌玉帝赐封的官职太低，大闹天宫，被太上老君困于炼丹炉内四十九天后，大圣踢翻炼丹炉，炼成了金睛火眼。如来佛祖见局势不可收拾，于是将大圣镇压于五指山下。一晃眼五百年过去了，唐僧被观世音菩萨选为西去取经普渡众生的人，大圣受观音指引，拜唐僧为师，师徒踏上了取经的路途。
一天，月亮在这个学园变成了红色的，一切都变了，原本力量强大的海地司被熇炎带进反噬镜，破坏时空封印的部分结界，不慎开启被封印多年时空裂缝，窜出的闇黑气息连带影响日月潮汐，萌学园的生活都变了，夸克族会打败闇黑势力吗？
