因一场车祸齐思哲失去了女友俞菲，但他发觉意外背后另有隐情。为调查真相，齐思哲入职成为河城市公安局的刑侦法医，却被迫卷入一桩桩奇诡悬案之中。在侦破过程中，他与祝青越、韩烽抽丝剥茧屡破奇案，而牵涉当年俞菲之死的“原钻”案，也逐渐展露冰山一角。
华京生（黄秋生 饰）的母亲死后，父亲再娶了林莲好（吕有慧 饰）为妻，林莲好生下了华京生同父异母的弟弟华港生（吴岱融 饰）。华京生和家人的关系一直不好，在设计逼走林莲好之后，个性叛逆而又倔强的他和好友李劲泉（郑浩男 饰）一起前往台湾，加入了当地的黑帮。哪知道此时黑帮老大的情妇，正是他曾经的后母林莲好，而她的儿子鲁德培（郑伊健 饰）也在帮派之中。 那边厢，个性懦弱而又胆小的华港生为了证明自己的能力，成为了一名警察，进入了鲁德培领导的黑帮做卧底，而不知华港生真实身份的鲁德培，竟然爱上了自己同母异父的兄弟。
上官逸是最完美的古代翩翩公子！出身于在武林享有盛誉的上官世家；思维缜密、武功高超，擅于追查武林奇案，为“三散人”之一，有“千里追踪”之美誉；对朋友忠义两全、肝胆相照，对恋人体贴有加、关心入微；在他的倾力帮助下，白家冤案得以昭雪。 期间，上官逸更与白玉瑛有凄婉动人的爱情。瑛因身负灭门家仇，性格变得冷酷偏激，本一心练“迷离大法”复仇别无他想，对逸的关爱怜惜也冷漠处之，起初更曾在其双臂钉下毒钉。但渐渐却无可自欺地爱上逸，苦於其“迷离大法”不容儿女私情，令二人无法携手。他们几乎未有过花间月下之浪漫，更多的是对对方的思念…… 查案过程中，上官逸得识“百晓生”诸葛无缺之女、体弱但睿智的诸葛静。二人共同追查白家命案，合作无间，静亦对逸心生爱慕。逸虽对静照顾有加，但内心只对瑛一往情深。最后，瑛终为报仇而身死，临死将逸托於静。白家冤案撤清后，逸与静继续闯荡江湖，并撰写武林史书。
神箭山庄自古以来就以神龙令领导江湖，与神秘组织大堡垒长期抗衡，但未见胜果。与此同时，各门派的高手陆续失踪，令局势更加扑朔迷离。庄主连城的独子连箭为了追寻御用金，假扮成大盗乔三在江湖上行走。大堡垒的堡主楚天威派出手下孤竹无名以保家之身份与箭接触。而箭为夺取御用金，特地向武器世家列家的女当家列枫订制弓箭。枫本是箭未过门的未婚妻，但箭对她心生意欲，却隐瞒了自己未婚夫的身份，积极追求她。然而，枫对箭的行为感到厌烦。 另一方面，来自浪族的女子月影沙丘为了拯救族人于灭族危机，带领族人前往中原寻找能改变族人命运的圣物。为解决资金问题，她决定与箭争夺御用金。在争夺中，月影与箭展开明争暗斗，水火不容。然而，在一次偶然的机会下，孤竹救了连箭，两人因此成为了好友。后来，大堡垒主威对箭十分赏识，命令孤竹招纳箭，否则杀无赦。为了试探箭，他命令箭入侵神箭山庄盗取神龙令，一旦失败即判处死刑。箭进退两难，身陷重重危机。为了生存，他不得不制造假象与神箭山庄结下深仇，并加入大堡垒以探查真相。
