新的一年到来，青青草原涌现了更多的乐趣。先是懒羊羊身上发生奇妙的变化，一起意外让他拥有了神奇的超能力，由此引发了无数好玩有趣的事情，也令灰太狼遭受无数磨难，苦不堪言；而灰太狼的宝贝儿子小灰灰一天天长大，为了让灰灰顺利完成成狼礼，他想出诸多诡计帮儿子抓羊。而小灰灰不仅成功进入羊村上学，还令灰太狼与小羊们达成和解。在此期间，香太狼女儿香香也隆重出场，小灰灰终于要面对狼生路上的各种抉择。 奇妙搞笑的故事不断上演，各种神奇的道具更是层出不穷，懒羊羊和小灰灰的全新戏剧轻松道来……
故事发生在战国时代，普通人家出身的男孩猪名寺乱太郎祖辈曾是忍者，在父亲的劝说下，他离开家乡摄津，进入当时一流的忍者学园学习。在学校，他认识了与之同龄的新兵卫和雾丸。新兵卫是一个出身富商家庭的小胖子，为人迷迷糊糊，对吃尤为感兴趣；雾丸则是身世贫苦的孤儿，为人精明，贪财吝啬。这三个性格迥异却的小家伙成为好朋友，他们最大的共同点就是经常因为考试不及格受到处罚。当然，以校长大川平次涡正为首的老师们也都是性格古怪且鲜明的爆笑人物，乱太郎他们和周围的同学、老师一起上演了连番搞笑、有趣的精彩好戏…… 本片根据漫画家尼子騒兵衛原著《落第忍者乱太郎》改编，改编成动画时，因NHK电视台的禁忌而将“落第”二字去掉。
喜羊羊及灰太狼等一众守护者们为了提升能力，进入深山密林进行特训，他们分别找到了传说中的两所训练营，羊狼们分别进入不同的训练营，开始了各自神奇奇术和炫酷发明的训练生涯。训练过程中笑料频出，大家克服重重困难学到了本领，也建立起深厚的友谊，两大阵营联手迎击来自未知世界的反派，开启羊村守护者全新的篇章。
黄河、长江、澜沧江起源一处，“水诡”三姓（丁、姜、易）沿江而居。何为“水诡”，他们可以在水中自由来去，并且拥有堪舆风水，寻龙探宝之技。易飒，作为易家最后的水诡，经营着澜沧江一带的“水下银行”生意。在一次“开金汤”的过程中，易飒偶遇并救下了宗杭。为了找寻当年真相和能够拯救自己，易飒训练宗杭成为专业“水诡”，和丁家水诡丁玉蝶一起三人下水进入“祖源金汤”。
上古时期妖兽纵横，一位神秘道人分别授予了阴阳五行的特殊能力给金木水火土五个家族来抵抗妖兽，他们将妖兽驱赶到神隐雾山之中，设立结界。 雾山之中另有被封印于巨阙神盾之中的具有强大灵力的麒麟兽，常常吸引来那些想要提升妖力突破结界的妖兽。火行使者闻人翊悬为救其母私自打开了巨阙神盾，小麒麟趁机偷溜出来，妖兽界将掀起一 股腥风血雨......
