狼将军利用各法宝强化七大恶狼攻打羊村。为保羊村,众羊寻找各种方法,意外获得羊族前辈的神奇武器。一路上小羊们用神奇装备打退群狼多次攻击。被小羊们的善良团结感动的灰太狼,帮助众羊终于打败狼将军,草原实现了真正和平!
第四次非核大战一年后的2027 年,在还留有战争痕迹的新滨市,发生一起疑似收贿的军人遭到枪杀的案件。雨幕中,公安‧荒卷大辅为了找寻军人的电子脑而潜入墓地,却遭到想证明上司清白的草薙素子持枪抵住身后。但是,追查这起案件的并非只有草薙一人,拥有「不眠之眼」的巴特怀疑她就是爆破杀伤事件的犯人,因而紧咬着不放;以及正持续追查枪击案与娼妓命案间共通点的新滨县的刑警‧德古沙。此外,「501 机关」的徕津中佐也正注视着草薙的行动。为了寻找自身的未来与理想,草薙的本能将自此觉醒(ARISE)……。