从前有座灵剑山

女主角“不动纯”是一个有特殊体质的人,她可以变身成“恶魔人”。有一个专门的组织和她达成了协议,由她来消灭其他的恶魔人。就在女主角消灭了一个又一个恶魔人之后,组织里的头头“兰”开始了一项可怕的计划。原来,世界上有很多人都有突变为恶魔人的体质,只是未被触发而已。兰宣称为了不让更多的人变成恶魔人,要给全世界的人注射预苗,而这预苗其实就是诱发基因突变的药物。很多人变成了恶魔这些恶魔人被就因为长的怪就给正常人欺负可以说是没有了人权。而兰也是只个很特殊的人,他利用女主角对他隐隐约约的感情和她完成了最后的仪式。

　　十多年前一只拥有巨大威力的妖兽“九尾妖狐”袭击了木叶忍者村，当时的第四代火影拼尽全力，以自己的生命为代价将“九尾妖狐”封印在了刚出生的鸣人身上。木叶村终于恢复了平静，但村民们却把鸣人当成像“九尾妖狐”那样的怪物看待，所有人都疏远他。鸣人自小就孤苦无依，一晃十多年过去了，少年鸣人考入了木叶村的忍者学校，结识了好朋友佐助和小樱。佐助是宇智波家族的传人之一，当他还是小孩的时候他的哥哥——一个已经拥有高超忍术的忍者将他们家族的人都杀死了，然后投靠了一直想将木叶村毁灭的大蛇丸，佐助自小就发誓要超越哥哥，为家族报仇。鸣人他们在忍者学校得到了教官卡卡西的精心指点，在他的帮助下去迎接成长中的一次又一次挑战！

　　舞台是在某个国家的某个地区莫斯特城市。
　　在陈旧大楼的二楼有一家发行《月刊妄想科学》的小出版社。
　　《月刊妄想科学》是一本异想天开，报道“真是吓人一跳！”的事件、即使是科学家也会发出“要不行啦！”声音的超科学现象的科学杂志。
　　工作人员只有帅哥主编兼编辑的塔罗·J·铃木。再加上小学生助手吉罗·田中和狗狗三郎。
　　编辑部一直是空的，塔罗、吉罗和三郎都沉浸在同一栋大楼1F的咖啡馆《岩石（ROCK）》中。
　　有一天，科学家戈洛·佐藤前来咨询，由此开始了一个异想天开的故事……。