随着和平的到来而走向近代化的木叶忍者村。高楼林立，巨大显示屏中播放出影像，连结各区域的电车在村里奔驰。虽说是忍者村，但一般民众也增多，忍者的生存方式也在逐渐改变的这个时代—— 村子的领袖，第七代火影·漩涡鸣人的儿子慕留人，进入了培育忍者的学校“忍者学校”。周围的学生们带着“火影的儿子”这样偏见的目光看待慕留人，但慕留人凭借天生的破天荒性格将这种小事轻松越过！ 慕留人与新的伙伴相遇，他将如何挑战突然发生的神秘事件？ 在众人心中如疾风般狂奔的“漩涡慕留人”的物语，现在开始！！
故事將圍繞綠谷出久與死柄木弔的對峙、轟焦凍與其兄轟燈矢了斷家族恩怨，以及麗日御茶子與渡我被身子的相遇展開，同時也將迎來歐爾麥特與「人人為我」的戰鬥結局。
「……原来我，可以活着呀。」明明能力值为零，却被选进勇者小队的芙兰姆。唯一拥有的是种名为「翻转」的莫名能力。果不其然，虽在战斗中完全派不上用场，仍不气馁努力为小队奉献。然而队中一位赫赫有名的天才贤者吉恩却看她不顺眼，不只动不动就找碴，最后甚至硬是把她卖给了奴隶商人。在奴隶商会内受尽折磨的芙兰姆，某天为了娱乐目的，即将沦为怪物的大餐。没想到，当她举起号称一拿到手就会将身体融化的「诅咒大剑」瞬间——她的人生急遽翻转。
