进入三月，第三学期也剩下一个月。麻衣的毕业典礼这一天终于来临。 “叔叔，你是谁？” 咲太在七里滨海岸等待麻衣时，酷似童星时代的麻衣的小学生出现在他面前？ 另一方面，花枫事件之后就分开住的咲太父亲来电…… “你妈妈说，她想见花枫一面。” 无法接受花枫发生的事件而长年住院的母亲传达“想见她一面”的心愿…… 家人的羁绊，新思春期症候群的征兆──
全人类因谜般的现象而在一瞬间石化，之后过了数千年——。 拥有超越人类的头脑，天生的科学少年·千空苏醒了。 “从石器时代到现代文明，要跨越这科学史上的200万年！”。 在这走投无路的状况中，千空寻找着伙伴，决心取回原先的世界！
互いへの想いを通じ合わせた涼と颯馬は、ついに恋人同士に。 心もカラダもより深く繋がってラブラブな日々…と思いきや、涼の職場に元カレ・玲が現れて！？ 3人の頭をよぎる、すれ違った学生時代の記憶。 関わるまいとする涼だが、玲とチームを組むことになってしまい――
再び大海原に飛び出した 千空達の旅路をお楽しみに‼
