名门木叶学院转入一个神秘的转校生漩涡鸣人，就此一段忍者们的校园生活展开了。
林动为了从百朝大战中脱颖而出，带着同伴小貂、小炎深入危机四伏的远古密藏寻找机缘。经历重重艰险后，他击败了宿敌林琅天，在四宗殿的青龙殿获得殿主的武学传承，还获得生死转轮丹，帮助小貂重塑了身体。此后，林动又通过挑战超级王朝参赛者以提升自己积分排名的方式，成功获得了百朝大战冠军之战的参赛资格，并在万众瞩目中再次将林琅天彻底打败。然而，心存不甘的林琅天却与潜伏在百朝大战战场上的西玄域奸细勾结，启动封天阵图要夺走百朝大战所在的远古战场，并将林动等人置于死地。最终，林动带领众多参赛者，齐心协力破解西玄域阴谋，捍卫东玄域利益。林动因此成为百朝大战冠军，并加入超级宗门中的道宗。
一位单亲妈妈带着两个小孩经营一间闹鬼的酒店，她的哥哥也是酒店里的鬼魂之一。
《JoJo的奇妙冒险OVA第一期》(1993年-1994年，共6话)是根据原作漫画第三部后半部分改编的动画作品，描述发生在埃及的战斗。另外，第二期OVA(2000年-2002年，共7话)改编的是原作漫画第三部前半部分的内容。 2007年5月25日发售的《JoJo的奇妙冒险 第3部 星尘斗士 DVD-BOX》(共13话)收录了OVA第一期和第二期的全部内容，并按故事发生的时间先后顺序，把OVA第一期安排为第8话到第13话。 OVA第一期在2007年DVD-BOX中的话数安排如下： 話数标题 発売日 Adventure 8「愚者」のイギーと「ゲブ神」のンドゥール -前編- 1993年11月19日（VHS、LD） 2002年8月23日（DVD） Adventure 9「愚者」のイギーと「ゲブ神」のンドゥール -後編- 1993年12月17日（VHS、LD） 2002年8月23日（DVD） Adventure 10ダービー・ザ・ギャンブラー 1994年7月21日（VHS、LD） 2002年9月20日（DVD） Adventure 11DIOの世界 -亜空の瘴気ヴァニラ・アイス- 1994年8月9日（VHS、LD） 2002年9月20日（DVD） Adventure 12DIOの世界 -花京院 結界の死闘- 1994年10月21日（VHS、LD） 2002年10月25日（DVD） Adventure 13DIOの世界 -さらば友よ- 1994年11月18日（VHS、LD） 2002年10月25日（DVD）
