《百花缭乱 武士少女》是日本ホビージャパン（Hobby JAPAN）出版社创业40周年的跨媒体制作企画。该企画的小说作者为日本的编集者、著作家·铃木ドイツ（すずきあきら）【铃木晓】。同时TV动画也预计在2010年10月开始在独立UHF局以及AT-X电视台播放。但在2010年9月3日在TOKYO MX电视台先行播放了第一话。故事发生在21世纪初叶的日本，此时的年号是“平诚”。虽然锁国政策已经完结，但德川幕府的统治还在继续。在富士山的山脚有一间巨大教育机构·武应学园塾。这里的部分学生对德川家进行反抗，学生会执行部称其为“丰臣狩猎”，并对其进行镇压。本作的主人公、柳生道场的代理师傅·柳生宗朗虽世代为德川效力，但他却对执行部的镇压行动抱有疑问，为此却被学生会命令撤走道场。撤走期限即将来临之际的一天晚上，宗朗与真田幸村后藤又兵卫被学生会直辖部队追杀逃进柳生道场秘密房间后，突然从天空堕下一名手持双刀的全裸美少女。自称柳生十兵卫三严的少女击退了强袭道场的服部忍者，从此之后，就有众多日本历史上的武将以少女身份出现在宗朗面前。
上伊那ぼたんは20歳の大学生。入った寮の歓迎パーティで寮長のいぶきにハイボールを飲ませてもらうと酔った勢いでいぶきに絡み始めて・・・?酔っ払いいちゃいちゃガールズコメディ開幕！
风宫库洛自幼和父亲过着相依为命的生活，哪知道，有一天，这唯一的依靠也不告而别，只留下高筑的债台，需要库洛来偿还。为了还债，库洛来到了债主白龙院家，他将在那里担任男仆的职务，用劳动来抵债。白龙院家的少爷米斯是一个性格古怪充满了恶趣味的人，他给身为男性的库洛穿上了女仆的制服，以此为乐，并且不断的骚扰着库洛，令后者十分苦恼。 弗雷是米斯同父异母的弟弟，两人虽为兄弟，却亦是白龙院家主地位的竞争者。和飞扬跋扈的米斯不同，弗雷看上去安静而又温顺，可实际上，他内心里的算盘打得十分精明。弗雷和米斯同时爱上了库洛。
被杀了。果然又被杀了。追月朔也是一位半吊子的高中生侦探，有一个被称为“传说中的名侦探”的父亲。今天本应也该接受委托，然后兴致勃勃地去做一些找猫、或是调查外遇之类的平凡的工作，不知为何他却被杀人事件卷入。而且“被害者”居然是自己！？多亏特殊体质每次都能重生的朔也，用膝枕迎接他的则是优秀的助手莉莉提亚。「您又被杀了呢，侦探大人。」「......似乎是呢。」作为侦探，以及作为受害者，朔也如字面意思，搏命解决了无数的疑难案件。
将清纯可人的“租借”女友·水原千鹤介绍给家人和朋友，谎称她是“真”女友的废柴大学生·木之下和也。 在无法说出真相的情况下，和也继续维持着这段“虚假”的关系。在共同经历各种事件的过程中，他内心对千鹤的“真实”感情日益加深。 电影制作的众筹活动成功之后，和也终于下定了追求千鹤的“决心”。 然而另一方面，个性略显强势的“临时”女友·更科瑠夏，却以比以往更加积极的态度向和也逼近……！ 更雪上加霜的是，知晓和也与千鹤“真实”关系的小恶魔系前女友·七海麻美突然接近千鹤，引发了紧张局面！？ 故事卷入周遭人物，愈发白热化！ 而后，舞台转移到了水族馆！！
