自那之后已经过去了5年。Amazon几乎被驱除,世界趋于和平。但是被Amazon细胞感染的普通人Amazon化的现象在持续发生扩大,为此政府组成了新组织4C,秘密驱除Amazon化的人类。 其中,幼年时期被Amazon养大的少年·千翼变身假面骑士Amazon Neo与Amazon战斗。但在被生来的吃人冲动所驱使的他的面前出现的是,变身为乌鸦Amazon并作为生物兵器战斗的少女·优。对于这样的优,他第一次没有产生“想吃”的想,并被她吸引着。而优的真面目是被Amazon化的父亲杀死后,作为Sigma型而复活的Amazon。
时间是西元2040年。罹患罕见疾病的青年·怜人,在与青梅竹马绘理沙相约再会之后接受了冷冻睡眠治疗。过了5年后,怜人醒来之后等待他的却是全世界99.9%的男性皆感染病毒而死,现存50亿人口大多为女性的世界。近未来情色悬疑物语就此开幕。