在不远的未来,地球迎来了一位神秘的天外来客——帕莫,它是宇宙智慧文明希尔人的运输飞船,携带着6400万年前消失的恐龙重归地球。希尔人在将恐龙带到地球的同时,也给人类带来了先进的基因技术,人类由此进入了一个全新的时代。 然而,邪恶组织却利用先进技术培育出了危险的变异恐龙,妄图统治人类世界,英勇的X26小队再次出战,通过激烈的战斗,最终将邪恶组织消灭。可是,变异后的恐龙却以超过人类想象的速度迅速进化。 百年之后,恐龙已经占据了地球绝大地方,人类生存空间仅限于地下。一位恐龙基因的合成人,在寻求自身命运的同时,发现了埋藏在历史中的真相。踏上了一条消灭变异恐龙、复兴人类文明的艰险之路。
2050年,太平洋深处孤岛的猩红别墅里,一群失忆女孩被圈养,唯有编号12的安晓尚存一丝本能。一次意外,她在储藏室撞见尸骸,唤醒了对自由的渴望,与执念寻找失踪姐姐(编号07)的林溪结成同盟。别墅主人莉娜被医生李鸣精神控制,以“被选中”为诱饵,推行末位淘汰规则。夜间“吸氧”实为记忆唤醒药物,安晓频繁梦见过往。编号5的女孩被带走时,甩出一枚鸢尾发夹,林溪认出是姐姐同款,探寻决心更甚。安晓自伤求医时,发现李鸣处有与自己相似的女孩照片,身世成谜。二人潜入储藏室,揭开“活体供体”真相——女孩们的激素被卖给富豪,林溪姐姐已因激素衰竭被“处理”。理念分歧让二人决裂,林溪独自刺杀莉娜,却得知安晓是莉娜的女儿,也是李鸣培育的“完美供体”。殊死搏斗中,林溪护安晓被麻醉,莉娜奋力护女,安晓恢复记忆后彻底反抗,这群女孩终在守护与救赎中破茧重生。
作为系列最终章的本次剧场版,将描绘挑战世界的遥等人。主角一行人所前往的新舞台,是过去曾经造访过的雪梨。在展开旅途之前的休息期间,遥偶然遇上了与曾在日本选拔大会中对战的选手,并展现了自己的斗志。而在雪梨的大赛中,来自各方的选手们将展开激烈的竞争。
主人公方寒在经历了残酷的仙魔斗争、同门的尔虞我诈、挚爱红怡牺牲之后,内心逐渐从懵懂少年成长为沉着果决的男人。