28世纪前夕，地球人口剧增，生存资源极度匮乏，在人类星际移民初步阶段，为抢夺地外资源，各国掀起新的军备竞赛。 宇宙最强军事商业联盟大夏联盟，属下三大最强舰队：红鳞、昆仑、三足乌舰队，此外还有几千个中小型舰队，其中舰队的主战力为仙女武装适用者。 靠这些舰队开拓收集地外资源，才供养得起六百亿人的社会。 但同时人类社会内部资源争夺战也从未停止。 故事中的人类社会与现实世界区分不大，虽有高端科技，但平民享受不到。 男主慕斯云带领仙女铁姬们征战星域，宏大的故事徐徐展开。
进入三月，第三学期也剩下一个月。麻衣的毕业典礼这一天终于来临。 “叔叔，你是谁？” 咲太在七里滨海岸等待麻衣时，酷似童星时代的麻衣的小学生出现在他面前？ 另一方面，花枫事件之后就分开住的咲太父亲来电…… “你妈妈说，她想见花枫一面。” 无法接受花枫发生的事件而长年住院的母亲传达“想见她一面”的心愿…… 家人的羁绊，新思春期症候群的征兆──
继火祀集团的青龙社长被火车残忍轧成两段之后，金田一一（松野太纪 配音）和七濑美雪（中川亚纪子 配音）受好友井泽研太郎（内山昂辉 配音）之托来到火祀家位于轻井泽的葡萄之馆，并见证了社长两名养子九曜（宫野真守 配音）和晓（及川以造 配音）的死亡。神秘的黑魔法以及带有诅咒和 预言气息魔法人偶，令这座公关被死亡的恐怖气息笼罩。人人自危，不知谁是下一个牺牲者。但是经过缜密的推理与调查，金田一终于逼近事实真相。他在众人面前指认凶手，结果令在场的每一个人出乎意料…… 本片为金田一少年事件簿系列20周年纪念作品。
