2002年，数码世界面临灭亡的危机！数码世界本是由究极天使兽、基路比兽及神圣天女兽三大天使所管治的，然而其中一位天使——基路比兽却叛变，这使得数码世界的平衡受到破坏，并开始崩溃…… 古代曾经拯救数码暴龙世界的十斗士现在已不存在。就在这危急关头，十斗士的斗士精神把新力量给予了另一个世界——现实世界的孩子…… 主角拓也等人，将进入数码世界，变身成数码暴龙，投入这场冒险与战斗的旅程！
故事发生在由德川幕府统治的江户时代，设定中，胸部的尺寸成为了定夺一切的标准，胸大则成王，胸小为败寇。因此，拥有着祖传的可以使胸部增大的秘传书的魔乳一族，其手中才真正掌控着一切的生杀大权，家族中的长老魔乳胸侧（斧敦志 配音）更是以其高超的剑术闻名于江湖之中。作为魔乳家的小女儿，魔乳千房（寿美菜子 配音）一直都对魔乳家女性的悲惨命运深感不平，她本人更是发誓，不被家族的命运所掌控。 魔乳家代代相传的秘传书被窃了，小偷不是别人，正是家族继承人千房本人。一石激起千层浪，在利用秘传书帮助广大女性的同时，千房还要面对从各路聚集而来的，对秘传书心怀不轨的忍者刺客。同时，魔乳家族也部下了天罗地网，誓要捕获她这个叛逃者。
喜羊羊及灰太狼等一众守护者们为了提升能力，进入深山密林进行特训，他们分别找到了传说中的两所训练营，羊狼们分别进入不同的训练营，开始了各自神奇奇术和炫酷发明的训练生涯。训练过程中笑料频出，大家克服重重困难学到了本领，也建立起深厚的友谊，两大阵营联手迎击来自未知世界的反派，开启羊村守护者全新的篇章。
战国时期，老爷曾经像魔神一样活跃，但那个时代已经过去了。老爷已经彻底堕落，住在贫民窟里，过着穷困潦倒的生活。这时候他遇到了一只狗，并可怜这只奇怪的短腿动物，向它伸出了援助之手，但是……他的新家臣的调皮行为让他受到了各种各样的摆布！
司馬宙はカーレースで瀕死の重傷を負い、父親である司馬博士の技術でサイボーグとして生まれ変る。すでに司馬博士自身は亡くなっているが、その知能と意思の全てが巨大コンピュータの中に収められ、マシンファーザーとして司馬を指導する。司馬博士殺される原因となったのは、彼が発掘した銅鐸が、敵の古代帝国である邪魔台国の重要な秘密を握っていたためだ。それが今、司馬宙の体内に埋め込まれている。その銅鐸を奪うために、古代よりの侵略者、女王ヒミカとその配下たちが操るハニワ幻人が襲来する。卯月美和の乗るビッグシューターから射出されるジーグのパーツと、頭部に変形する宙が合体、鋼鉄ジーグとなって磁力を駆使した戦闘用オプションパーツを使いハニワ幻人を倒し、ヒミカの野望を打ち砕く！
