故事发生在战国时代，普通人家出身的男孩猪名寺乱太郎祖辈曾是忍者，在父亲的劝说下，他离开家乡摄津，进入当时一流的忍者学园学习。在学校，他认识了与之同龄的新兵卫和雾丸。新兵卫是一个出身富商家庭的小胖子，为人迷迷糊糊，对吃尤为感兴趣；雾丸则是身世贫苦的孤儿，为人精明，贪财吝啬。这三个性格迥异却的小家伙成为好朋友，他们最大的共同点就是经常因为考试不及格受到处罚。当然，以校长大川平次涡正为首的老师们也都是性格古怪且鲜明的爆笑人物，乱太郎他们和周围的同学、老师一起上演了连番搞笑、有趣的精彩好戏…… 本片根据漫画家尼子騒兵衛原著《落第忍者乱太郎》改编，改编成动画时，因NHK电视台的禁忌而将“落第”二字去掉。
故事发生在由德川幕府统治的江户时代，设定中，胸部的尺寸成为了定夺一切的标准，胸大则成王，胸小为败寇。因此，拥有着祖传的可以使胸部增大的秘传书的魔乳一族，其手中才真正掌控着一切的生杀大权，家族中的长老魔乳胸侧（斧敦志 配音）更是以其高超的剑术闻名于江湖之中。作为魔乳家的小女儿，魔乳千房（寿美菜子 配音）一直都对魔乳家女性的悲惨命运深感不平，她本人更是发誓，不被家族的命运所掌控。 魔乳家代代相传的秘传书被窃了，小偷不是别人，正是家族继承人千房本人。一石激起千层浪，在利用秘传书帮助广大女性的同时，千房还要面对从各路聚集而来的，对秘传书心怀不轨的忍者刺客。同时，魔乳家族也部下了天罗地网，誓要捕获她这个叛逃者。
もう『器用貧乏』なんて言わせない！いつか『万能者』と言われる探索者になってやる！ある日のこと……所属している「勇者パーティ」のリーダーであり、幼なじみのオリヴァーから実力不足を理由に追放を言い渡されたオルン・ドゥーラ。パーティのために【剣士】から【付与術士】へとコンバートし、独自に開発した魔術で仲間をサポートしてきたオルンにとっては到底、納得のいくものではなかった。しかし、苦楽を共にしてきたはずの仲間からも『器用貧乏』だとバカにされ、すでに後任者も決まっているという。失意のなか、「勇者パーティ」に別れを告げたオルンは探索者としての決意を新たに、ソロ活動を始めるのだが……。抜け落ちた記憶…理不尽さへと立ち向かう力…新たなる出会いの数々が、オルンの運命を大きく変える。大切な仲間を護るため究極の『器用貧乏』は、最強の『万能者...
