女主角“不动纯”是一个有特殊体质的人,她可以变身成“恶魔人”。有一个专门的组织和她达成了协议,由她来消灭其他的恶魔人。就在女主角消灭了一个又一个恶魔人之后,组织里的头头“兰”开始了一项可怕的计划。原来,世界上有很多人都有突变为恶魔人的体质,只是未被触发而已。兰宣称为了不让更多的人变成恶魔人,要给全世界的人注射预苗,而这预苗其实就是诱发基因突变的药物。很多人变成了恶魔这些恶魔人被就因为长的怪就给正常人欺负可以说是没有了人权。而兰也是只个很特殊的人,他利用女主角对他隐隐约约的感情和她完成了最后的仪式。
三年前的8月31日,“侵略者”巨大的母舰突如其来地降临在东京,眼看这个世界即将迎来末日。 自此之后,绝望渐渐地融入了日常生活;大大的飞碟盘旋于空中,今天也依然不变地持续环绕着世界。而在还没有来到世界末日的此刻,小山门出、中川凰兰这两个高中女生的青春时代才正要展开。