进入《迷宫饭》弱肉强食的世界，不想被吃，就要勇敢开吃。 地下城深处，莱欧斯的妹妹惨遭炎龙吞噬，莱欧斯自己也差点没命，好不容易才逃出生天。 现在，他决定要重返地牢，但他的钱和粮食却都还留在地下城深处。眼看妹妹困在龙肚里，随时都可能被消化殆尽，莱欧斯决定边走边猎食！无论是史莱姆、蛇怪、宝箱怪，甚至恶龙，来一个吃一个，来两个吃一双！ 冒险者，前进吧！勇闯地牢深处，吃光所有挡路的魔物。
故事发生在东京八丈岛近海，这里建成了一座连接了全球各地警方监控摄像的海洋设施“太平洋浮标”。在这座设施正式启动之前，为了与欧洲刑警组织管辖的范围联网，世界各国的IT工程师来到现场。而与此同时，一项应用了人脸识别系统的“新技术”的测试也在进行中…… 另一方面，柯南和少年侦探团在园子的招待下来到八丈岛赏鲸。此时，柯南接到来自冲矢昂（赤井秀一）的电话，被告知欧洲刑警组织的成员在德国遭到琴酒的杀害。为调查真相，柯南偷偷混进了前往“太平洋浮标”进行警备工作的黑田兵卫等警视厅人员乘坐的警备艇中，进入设施内部。之后，在为系统启动而稳步展开准备工作的设施内，发生了案件——一名女性工程遭到黑衣组织的绑架，而她手中装有某些情报的U盘也落到了黑衣组织的手里。 海中传来令人毛骨悚然的螺旋桨声。而此时身在八丈岛的灰原哀身边，也正有黑影在悄悄靠近……
