四名前西班牙特工在全球不同地点同时遇刺。西班牙国家情报中心发现，数十年前他们都在哥伦比亚参与了秘密的谢纳加行动。西班牙国家情报中心最出色的特工泽塔必须追查并保护唯一的幸存者，这将是他迄今为止最危险的全球任务。哥伦比亚顶级特工阿尔法将与泽塔并肩行动，而她似乎比他更了解谢纳加行动背后的秘密。
自黑船事件十余年后，闭关锁国的德川幕府正迎来剧烈的变革时刻。倒幕志士群雄并起，幕府派则加大倾轧力度，一时间山河动荡。少年剑客绯村剑心（佐藤健 饰）为了开辟万民自由的新时代，投身至长州藩倒幕军团首领桂小五郎（高桥一生 饰）麾下，并逐渐成长为诛杀清除那些阻挠倒幕之人的急先锋。一时间刽子手拔刀斋的威名传遍京都，而他偶然杀掉的下级武士，却在他的脸颊上留下了第一道无法消退的伤疤。不久之后，剑心邂逅忧郁沉默的女孩雪代巴（有村架纯 饰）。巴留在倒幕志士聚集的场所帮佣，在这一过程中她似乎也让始终绷紧心弦的剑心放松下来。但是被命运和时代所拨弄的二人，等待他们的仿佛只有永生的悲剧……rn本片根据和月伸宏同名漫画改编。
